Struktura JPK_FA zawiera wyłącznie faktury sprzedażowe, czyli są w nim wykazane tylko faktury (dokumenty wystawione poleceniem FAKTURA). Jeżeli w danym okresie nie zostały wystawione dokumenty tym poleceniem, plik JPK_Faktura będzie pokazywał taki komunikat.
W związku z tym sprawdź czy na pewno w okresie, za który generowany jest plik JPK_FA, były wystawione faktury (przy użyciu polecenia FAKTURA).